Une équipe internationale a publié récemment le premier séquençage des gènes de la flore microbienne intestinale humaine ou métagénome. Ces travaux, qui s’inscrivent dans le cadre du projet européen MetaHIT (METAgenomics of the Human Intestinal Tract : http://www.metahit.eu) coordonné par l’INRA, ont été réalisés sur des échantillons de selles de 124 adultes danois et espagnols en bonne santé, en surcharge pondérale, obèses ou atteints de maladie inflammatoire intestinale chronique. Le catalogue ainsi dressé contient 3,3 millions de gènes bactériens, soit 150 fois plus que le génome humain, et inclus la grande majorité (plus de 86 %) des gènes de la population étudiée. « Environ 40 % de ces gènes sont présents chez au moins un individu sur deux, indique l’INRA. Au moins 170 de ces espèces sont abritées par chaque individu et au moins 75 sont présentes chez plus d’un individu sur deux ».
Cette étude permettra de mieux comprendre les relations entre le microbiote intestinal et certaines pathologies. Des données qui pourront ouvrir la voie à la mise au point d’outils de diagnostic précoce.
Qin J et coll. A human gut microbial gene catalog established by metagenomic sequencing. Nature 2010 ; 464 : 59-65.
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