La maladie cœliaque peut s'accompagner de trois types d'atteinte hépatique. L'atteinte spécifique, l'hépatite cœliaque, est la plus fréquente. Elle se manifeste par une élévation isolée des transaminases, prédominant sur les Alat. Elle est corrigée par le régime sans gluten et son évolution vers la cirrhose est exceptionnelle.